Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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NEDD8Q15843 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
NEDD8Q15843 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
NEDD8Q15843 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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