Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HERPUD1Q15011 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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