Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NEDD9Q14511 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms