Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCINQ13939 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CCINQ13939 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCINQ13939 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCINQ13939 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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CCINQ13939 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCINQ13939 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCINQ13939 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCINQ13939 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCINQ13939 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCINQ13939 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCINQ13939 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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CCINQ13939 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCINQ13939 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCINQ13939 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCINQ13939 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCINQ13939 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCINQ13939 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCINQ13939 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCINQ13939 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCINQ13939 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCINQ13939 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCINQ13939 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCINQ13939 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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