Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATMQ13315 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC-0.97□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC-0.97□□□□□ -2.57
ATMQ13315 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATMQ13315 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATMQ13315 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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