Protein–RNA interactions for Protein: Q13066

GAGE2B, G antigen 2B/2C, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE2BQ13066 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GAGE2BQ13066 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.7 ms