Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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