Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
ERVV-2B6SEH9 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ERVV-2B6SEH9 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms