Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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GTF3C6Q969F1 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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GTF3C6Q969F1 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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GTF3C6Q969F1 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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GTF3C6Q969F1 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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GTF3C6Q969F1 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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GTF3C6Q969F1 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GTF3C6Q969F1 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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