Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBXN4Q92575 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN4Q92575 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN4Q92575 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN4Q92575 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN4Q92575 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN4Q92575 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN4Q92575 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN4Q92575 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN4Q92575 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN4Q92575 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN4Q92575 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN4Q92575 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN4Q92575 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN4Q92575 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN4Q92575 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
UBXN4Q92575 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
UBXN4Q92575 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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