Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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