Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCBQ16585 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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