Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
EEA1Q15075 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
EEA1Q15075 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
EEA1Q15075 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
EEA1Q15075 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
EEA1Q15075 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
EEA1Q15075 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC-1.04□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.07□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.08□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
EEA1Q15075 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
EEA1Q15075 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
EEA1Q15075 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
EEA1Q15075 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
EEA1Q15075 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
EEA1Q15075 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
EEA1Q15075 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
EEA1Q15075 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
EEA1Q15075 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
EEA1Q15075 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
EEA1Q15075 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
EEA1Q15075 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
EEA1Q15075 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
EEA1Q15075 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms