Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHPRHQ149N8 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHPRHQ149N8 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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