Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMCO1Q147U7 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
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SMCO1Q147U7 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMCO1Q147U7 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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