| RUNX2 | Q13950 | AC004866.1-201 | ENST00000411748 | 78 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL590556.1-201 | ENST00000423231 | 483 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SMG7-AS1-202 | ENST00000432837 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KRTAP13-6P-201 | ENST00000508999 | 371 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.706-201 | ENST00000516933 | 99 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBL5P4-201 | ENST00000562584 | 236 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090510.1-201 | ENST00000567456 | 425 nt | TSL 3 BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP006219.1-201 | ENST00000580258 | 472 nt | TSL 3 BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4435-1-201 | ENST00000582552 | 80 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR5092-201 | ENST00000583139 | 88 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZMYM1-203 | ENST00000373330 | 4203 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ANP32E-209 | ENST00000616917 | 2989 nt | TSL 2 BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR449A-201 | ENST00000362113 | 91 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1159P-201 | ENST00000362933 | 107 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA25B-201 | ENST00000365507 | 128 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-148P-201 | ENST00000384472 | 162 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR10B-201 | ENST00000385011 | 110 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-159P-201 | ENST00000391080 | 106 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-139P-201 | ENST00000391307 | 165 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007098.1-201 | ENST00000420122 | 367 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL445305.1-201 | ENST00000432577 | 575 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009238.1-201 | ENST00000442165 | 424 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009237.6-201 | ENST00000446969 | 424 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008154.1-201 | ENST00000453087 | 327 nt | TSL 3 BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008243.1-201 | ENST00000504955 | 389 nt | TSL 3 BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR449C-201 | ENST00000516047 | 92 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSPE1P18-201 | ENST00000517602 | 280 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022616.8-201 | ENST00000533569 | 253 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYCSP26-201 | ENST00000534107 | 320 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NDUFA5P6-201 | ENST00000542110 | 379 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNRPGP18-201 | ENST00000553000 | 214 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4672-201 | ENST00000583126 | 81 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | 7SK.7-201 | ENST00000603504 | 247 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL132822.1-201 | ENST00000617063 | 513 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC134503.1-201 | ENST00000633048 | 54 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BX322639.1-202 | ENST00000423987 | 2213 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND5P16-201 | ENST00000460269 | 1703 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | XRCC4-202 | ENST00000338635 | 1579 nt | APPRIS P4 TSL 2 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-137P-201 | ENST00000363680 | 108 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-42P-201 | ENST00000364738 | 142 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.364-201 | ENST00000365532 | 101 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.445-201 | ENST00000384168 | 102 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNY1P14-201 | ENST00000384426 | 108 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR518C-201 | ENST00000384822 | 101 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAJ26-201 | ENST00000390511 | 60 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR548P-201 | ENST00000408336 | 84 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01344-201 | ENST00000420760 | 261 nt | TSL 3 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC099799.1-201 | ENST00000439809 | 192 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL035666.1-201 | ENST00000446195 | 348 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01564-201 | ENST00000448327 | 566 nt | TSL 3 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.631-201 | ENST00000459607 | 101 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ANXA2P1-201 | ENST00000505539 | 926 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC096711.1-201 | ENST00000510967 | 347 nt | TSL 5 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-965P-201 | ENST00000516721 | 96 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA31.15-201 | ENST00000516771 | 132 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01570-201 | ENST00000561572 | 434 nt | TSL 3 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090517.1-201 | ENST00000569307 | 266 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL356055.1-201 | ENST00000602528 | 446 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1248-201 | ENST00000629190 | 106 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAP4K3-205 | ENST00000437545 | 3924 nt | TSL 5 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLC39A10-201 | ENST00000359634 | 5322 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF204P-201 | ENST00000416749 | 2397 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP456-201 | ENST00000364002 | 114 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.216-201 | ENST00000364205 | 93 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.358-201 | ENST00000365491 | 99 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA18.2-201 | ENST00000383865 | 132 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1227P-201 | ENST00000383981 | 107 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-546P-201 | ENST00000383991 | 107 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-52P-201 | ENST00000384190 | 164 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-611P-201 | ENST00000384276 | 104 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.557-201 | ENST00000384680 | 107 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAV41-201 | ENST00000390468 | 336 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-32P-201 | ENST00000411193 | 191 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007064.1-201 | ENST00000412238 | 351 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01509-202 | ENST00000423523 | 408 nt | TSL 3 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EIF1P2-201 | ENST00000428233 | 350 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL429P-201 | ENST00000479090 | 223 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL489P-201 | ENST00000486185 | 223 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL327P-201 | ENST00000488659 | 223 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-77P-201 | ENST00000516692 | 156 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.711-201 | ENST00000516993 | 102 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD116.3-201 | ENST00000517176 | 78 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC034114.1-201 | ENST00000520293 | 285 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090617.3-201 | ENST00000573670 | 475 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC125232.2-201 | ENST00000592457 | 143 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL356575.1-201 | ENST00000603008 | 283 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL049779.4-201 | ENST00000604500 | 156 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TEX41-243 | ENST00000614173 | 190 nt | TSL 5 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007485.1-201 | ENST00000616755 | 206 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL853P-201 | ENST00000617250 | 223 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ST7-OT4_2.1-201 | ENST00000619089 | 172 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U4.3-201 | ENST00000621047 | 82 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010297.1-201 | ENST00000623948 | 149 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MPP6-209 | ENST00000625307 | 126 nt | TSL 5 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IGHVIII-44-202 | ENST00000636235 | 289 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FO624990.1-201 | ENST00000636373 | 85 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DNAH14-210 | ENST00000439375 | 13548 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NEDD4-205 | ENST00000506154 | 6751 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CCDC148-202 | ENST00000409187 | 2523 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-76P-201 | ENST00000362903 | 159 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |