Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
KRR1Q13601 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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