Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CALCOCO2Q13137 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CALCOCO2Q13137 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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