Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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