Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL28Q13084 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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