Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRDP23468 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRDP23468 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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