Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF248Q8NDW4 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms