Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Q1T7F1 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Q1T7F1 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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