Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SCN5AQ14524 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.2 ms