Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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