Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
NEUROD1Q13562 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NEUROD1Q13562 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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