Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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