Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SGCGQ13326 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.3 ms