Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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