Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPEQ02224 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.03□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.2 ms