Protein–RNA interactions for Protein: P28356

HOXD9, Homeobox protein Hox-D9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9P28356 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD9P28356 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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