Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms