Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ERGIC2Q96RQ1 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms