Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SMC1AQ14683 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SMC1AQ14683 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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