Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCARB2Q14108 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCARB2Q14108 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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