Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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CDH18Q13634 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDH18Q13634 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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