Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PPFIA1Q13136 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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