Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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TRAF1Q13077 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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TRAF1Q13077 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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TRAF1Q13077 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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TRAF1Q13077 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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TRAF1Q13077 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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TRAF1Q13077 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRAF1Q13077 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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