Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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