Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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RFX8Q6ZV50 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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RFX8Q6ZV50 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RFX8Q6ZV50 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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RFX8Q6ZV50 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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RFX8Q6ZV50 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
RFX8Q6ZV50 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RFX8Q6ZV50 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
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RFX8Q6ZV50 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RFX8Q6ZV50 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFX8Q6ZV50 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RFX8Q6ZV50 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFX8Q6ZV50 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFX8Q6ZV50 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFX8Q6ZV50 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFX8Q6ZV50 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFX8Q6ZV50 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RFX8Q6ZV50 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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