Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
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RTL8BQ17RB0 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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RTL8BQ17RB0 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RTL8BQ17RB0 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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