Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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LAMA3Q16787 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
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LAMA3Q16787 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
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LAMA3Q16787 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
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LAMA3Q16787 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
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LAMA3Q16787 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
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LAMA3Q16787 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
LAMA3Q16787 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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