Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
RPE65Q16518 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPE65Q16518 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPE65Q16518 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RPE65Q16518 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RPE65Q16518 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RPE65Q16518 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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RPE65Q16518 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RPE65Q16518 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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