Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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SHPRHQ149N8 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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SHPRHQ149N8 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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