| RUNX2 | Q13950 | RNY1P16-201 | ENST00000363063 | 111 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD42.2-201 | ENST00000365570 | 69 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1040P-201 | ENST00000383974 | 107 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.460-201 | ENST00000384255 | 102 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U8.10-201 | ENST00000384260 | 133 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1274P-201 | ENST00000384557 | 107 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1072P-201 | ENST00000384703 | 107 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-443P-201 | ENST00000384780 | 107 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR487A-201 | ENST00000385009 | 80 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAJ6-201 | ENST00000390531 | 62 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCYBP2-201 | ENST00000407745 | 171 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | MTND4P28-201 | ENST00000426217 | 387 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO3P29-201 | ENST00000432119 | 779 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01549-201 | ENST00000440664 | 714 nt | TSL 3 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL161788.1-201 | ENST00000441805 | 169 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353705.4-201 | ENST00000449661 | 238 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL297P-201 | ENST00000483161 | 293 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC020703.1-201 | ENST00000505051 | 521 nt | TSL 3 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022493.2-201 | ENST00000506122 | 481 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-826P-201 | ENST00000516827 | 104 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC084816.1-207 | ENST00000538317 | 584 nt | TSL 4 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IGKV1-33-202 | ENST00000558152 | 324 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC080078.3-201 | ENST00000605407 | 463 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IGKV1D-33-202 | ENST00000611734 | 324 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005520.5-201 | ENST00000613926 | 164 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090574.1-201 | ENST00000623186 | 233 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073544.1-201 | ENST00000600110 | 1595 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NOC3L-201 | ENST00000371361 | 3455 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC062016.1-201 | ENST00000355719 | 319 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-874P-201 | ENST00000362390 | 105 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-859P-201 | ENST00000362728 | 107 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-9P-201 | ENST00000364951 | 139 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP240-201 | ENST00000365355 | 128 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA12.2-201 | ENST00000391040 | 156 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-63P-201 | ENST00000410792 | 194 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC063976.3-201 | ENST00000426849 | 329 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL445524.1-202 | ENST00000440665 | 416 nt | TSL 3 BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR2053-201 | ENST00000459295 | 91 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC027575.1-201 | ENST00000481064 | 460 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090096.1-201 | ENST00000489168 | 390 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HYDIN2-201 | ENST00000493714 | 554 nt | TSL 4 BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC096725.1-201 | ENST00000514266 | 313 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-470P-201 | ENST00000515954 | 104 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP005436.2-201 | ENST00000528458 | 252 nt | TSL 5 BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL132819.1-201 | ENST00000555595 | 208 nt | TSL 3 BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYP4A27P-201 | ENST00000567218 | 190 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PWRN1-209 | ENST00000568019 | 359 nt | TSL 3 BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092070.3-201 | ENST00000596041 | 337 nt | TSL 3 BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U4atac.1-201 | ENST00000618345 | 95 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008121.3-201 | ENST00000618726 | 433 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND5P10-201 | ENST00000603719 | 1809 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HELLS-201 | ENST00000239026 | 2740 nt | TSL 5 BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.11-201 | ENST00000362375 | 109 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-944P-201 | ENST00000364023 | 107 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-694P-201 | ENST00000364071 | 147 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-32-201 | ENST00000364079 | 82 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP125-201 | ENST00000364843 | 120 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA46.1-201 | ENST00000391069 | 153 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP494-201 | ENST00000410653 | 129 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP184-201 | ENST00000411071 | 108 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS26P42-201 | ENST00000413485 | 326 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL592435.1-201 | ENST00000416401 | 469 nt | TSL 3 BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MRPS18CP6-201 | ENST00000423587 | 223 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARL5AP4-201 | ENST00000430731 | 512 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL109933.2-201 | ENST00000452651 | 260 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SPAG11B-206 | ENST00000458665 | 444 nt | TSL 5 BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.639-201 | ENST00000458981 | 102 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL17P19-201 | ENST00000489069 | 552 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC145146.1-201 | ENST00000496370 | 254 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079340.1-201 | ENST00000504799 | 552 nt | TSL 4 BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-307P-201 | ENST00000516743 | 106 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA48.11-201 | ENST00000517015 | 89 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL590705.4-201 | ENST00000532209 | 134 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SUB1P3-201 | ENST00000564581 | 315 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL12P50-201 | ENST00000603116 | 116 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006023.1-201 | ENST00000603944 | 259 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL080274.1-201 | ENST00000605565 | 220 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PCGEM1.1-201 | ENST00000613431 | 131 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC133104.2-201 | ENST00000615272 | 193 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CEP44-203 | ENST00000426172 | 3037 nt | TSL 5 BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC114316.2-202 | ENST00000502934 | 2957 nt | TSL 2 BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYLC2-201 | ENST00000374798 | 2171 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARHGAP5-202 | ENST00000345122 | 9604 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.138-201 | ENST00000363462 | 102 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.146-201 | ENST00000363549 | 102 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.431-201 | ENST00000384086 | 102 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.463-201 | ENST00000384271 | 102 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-378P-201 | ENST00000384324 | 107 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR29B2-201 | ENST00000385055 | 81 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP210-201 | ENST00000391034 | 120 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA12-201 | ENST00000391162 | 147 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BCL2L11-207 | ENST00000405953 | 425 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01870-201 | ENST00000427042 | 390 nt | TSL 3 BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBE2V1P7-201 | ENST00000446395 | 340 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL365295.1-201 | ENST00000454942 | 514 nt | TSL 5 BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | snoU13.30-201 | ENST00000458951 | 104 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC069133.1-201 | ENST00000522857 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104581.2-201 | ENST00000572227 | 430 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |