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| RUNX3 | Q13761 | SNORA25.11-201 | ENST00000515935 | 105 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC139497.1-201 | ENST00000524042 | 501 nt | TSL 5 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355375.2-201 | ENST00000574825 | 175 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CPDP1-201 | ENST00000579660 | 283 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FGF7P1-201 | ENST00000582820 | 288 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3616-201 | ENST00000584070 | 92 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BNIP3P16-201 | ENST00000589779 | 534 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL133215.3-201 | ENST00000609801 | 448 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024581.2-201 | ENST00000619986 | 252 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.40-201 | ENST00000362645 | 93 nt | BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU6-527P-201 | ENST00000363425 | 104 nt | BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.490-201 | ENST00000384413 | 102 nt | BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | DEFB110-202 | ENST00000393660 | 189 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | DLEU2_5.1-201 | ENST00000615567 | 84 nt | BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC138058.1-201 | ENST00000620572 | 449 nt | TSL 3 BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | SEMG1-201 | ENST00000372781 | 1662 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF644-212 | ENST00000621077 | 2056 nt | TSL 5 BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NEDD4-205 | ENST00000506154 | 6751 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CAPS2-203 | ENST00000393284 | 3430 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CCSAP-202 | ENST00000366686 | 4399 nt | TSL 2 BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z75746.1-201 | ENST00000440243 | 2080 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | N4BP2L2-205 | ENST00000446957 | 2071 nt | TSL 5 BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-72P-201 | ENST00000362976 | 153 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD32A-201 | ENST00000364805 | 84 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-842P-201 | ENST00000384269 | 107 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD116-29-201 | ENST00000384516 | 83 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-23P-201 | ENST00000410545 | 195 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC074085.1-201 | ENST00000413598 | 418 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC097463.2-201 | ENST00000421074 | 142 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU6-612P-201 | ENST00000516909 | 102 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCARNA3-201 | ENST00000517097 | 143 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC109329.1-201 | ENST00000518744 | 317 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068992.1-202 | ENST00000519280 | 270 nt | TSL 3 BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC027018.1-202 | ENST00000534723 | 383 nt | TSL 3 BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | MIR3199-1-201 | ENST00000582434 | 88 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022596.1-201 | ENST00000582895 | 302 nt | TSL 5 BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4658-201 | ENST00000584344 | 65 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096772.1-201 | ENST00000609146 | 564 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL449363.1-201 | ENST00000617815 | 186 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL159153.1-201 | ENST00000619688 | 317 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR7157-201 | ENST00000635801 | 60 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099654.5-201 | ENST00000636479 | 350 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCDH11Y-203 | ENST00000362095 | 4220 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KIF20B-202 | ENST00000371728 | 6419 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.67-201 | ENST00000362870 | 100 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD114-19-201 | ENST00000363072 | 75 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-486P-201 | ENST00000363116 | 107 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL37P10-201 | ENST00000412884 | 288 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL139396.1-201 | ENST00000421137 | 167 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z82205.1-201 | ENST00000428456 | 297 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS15AP10-201 | ENST00000432472 | 382 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012308.1-201 | ENST00000451232 | 178 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL139109.1-201 | ENST00000455491 | 297 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL30P12-201 | ENST00000474666 | 353 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090096.1-201 | ENST00000489168 | 390 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL22P13-201 | ENST00000493291 | 347 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.670-201 | ENST00000516255 | 105 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |