Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
RUNX3Q13761 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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