Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MTM1Q13496 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms