Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
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SKP2Q13309 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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SKP2Q13309 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
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SKP2Q13309 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
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SKP2Q13309 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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SKP2Q13309 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
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SKP2Q13309 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SKP2Q13309 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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