Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTIFO43310 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTIFO43310 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTIFO43310 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CTIFO43310 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CTIFO43310 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CTIFO43310 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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