Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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HOXD1Q9GZZ0 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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HOXD1Q9GZZ0 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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HOXD1Q9GZZ0 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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HOXD1Q9GZZ0 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
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HOXD1Q9GZZ0 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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HOXD1Q9GZZ0 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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HOXD1Q9GZZ0 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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